在菱角湖湿地90种鸟类中，被列入国家II级重点保护动物有9种，分别为白琵鹭（Platalea leucorodia）、小天鹅（Cygnus columbianus）、白额雁（Anser aobifrons）、鸢（Milvus korschun lineatus）、鹊鹞（Circus melanoleucos）、灰鹤（Grus grus）、红隼（Falco tinnunculus）、红角鸮（Otus sunia）、斑头鸺鶹（Glaucidium cuculoides），另有34种列入省级重点保护动物名录。90种鸟类都属于国家保护的有益的或者有重要经济和科学研究价值的野生动物。